Organizaciones civiles de la entidad registran un repunte de la violencia en esta área protegida. Las víctimas son aborígenes de diversas etnias que están vinculados con la defensa de sus territorios.
Dos ONG mantienen su preocupación por la muerte y desaparición de indígenas en Amazonas y lo relacionan con la presencia de la FAN en la zona de Yapacana.